在用氣相色譜儀做測試時，即便是最干凈的樣品也會含有痕量或微量的非揮發(fā)或半揮發(fā)性物質(zhì)。在反復的多次進樣后，無論是干凈的或是相對較臟的樣品都會有非揮發(fā)性的雜質(zhì)沉積在色譜柱的入口端內(nèi)表面。
色譜柱的柱前幾米對于樣品是很重要的，在程序升溫的分析過程中，樣品譜帶首先堆積在這一段上，所以大部分的保留也是在這一段產(chǎn)生。
用一個色譜柱測試液（醇類混合溶液）可以更深入的研究半揮發(fā)性雜質(zhì)存在的影響。如果柱內(nèi)吸附有半揮發(fā)性雜質(zhì)或存在活性部位，醇類會有明顯的拖尾，而且保留時間長的醇（較后流出、揮發(fā)性較低）的拖尾現(xiàn)象更加嚴重。但若經(jīng)測試，醇類沒有拖尾現(xiàn)象，則可認為色譜柱還未被污染。
即便在樣品提取和準備時很仔細小心，但處理后的樣品中仍會含有半揮發(fā)性或不揮發(fā)的雜質(zhì)，即便其含量很小。但好的樣品前處理方式和使用清潔的容器還是能減少進樣帶入系統(tǒng)的污染物?？墒褂妙A柱來保護色譜柱，或在色譜柱前接一段1至5米長的未涂敷硅土柱，用以捕獲那些半揮發(fā)性及非揮發(fā)性的雜質(zhì)。